مطالعه ساختار وعملکرد فتوپروتئین mnemiopsin از گونه mnemiopsis leidyi
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم انسانی
- نویسنده محمودرضا آقامعالی
- استاد راهنما ریحانه سریری مجید تقدیر
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1390
چکیده
cdna نمیوپسین ( فتوپروتئین وابسته به کلسیم ) از یک شانه دار تولید کننده نور بنام نمیوپسیس لیدی کلون، بیان، تخلیص، تعیین توالی و تعیین هویت شد. این cdna از 621 جفت باز تشکیل شده است که یک پروتئین 206 اسید آمینه ای را کد می نماید. cdnaی کد کننده نمیوپسین از نمیوپسیس لیدی در e. coli بیان وسپس تخلیص شد که یک باند منفرد را با وزن مولکولی 27 کیلو دالتون روی ژل sds-page نشان داد. بعد از آماده سازی نمیوپسین semi-synthetic با استفاده از کلنترازین و edta در حضور cacl2 از خود فعالیت لومینسانس نشان داد. مقایسه دو گروه معروف فتوپروتئین های وابسته به کلسیم یعنی کلنتراتها و کتنوفورها تشابه بالایی در ساختار سوم آنها بدون توجه به تشابه پایین توالی میان آنها نشان داد. این فتوپروتئینها با تشابه پایین توالی می توانند نقش مهمی در درک اساس ساختاری فعالیت بیولومینسانس داشته باشند. سکانس آمینو اسیدی حاصل از ژن نمیوپسین حدود 90 درصد تشابه با فتوپروتئین های کتنوفوری و 51 درصد با فتوپروتئین های کلنتراتی نشان داد. آنالیز توالی و ساختار افزایش تعداد بارهای منفی لوپهایی که کلسیم به آنها متصل می شوند را در کتنوفورها به نسبت کلنتراتها نشان داد که منتج به حساسیت بیشتر و بالا برای اتصال به کلسیم می باشد. بعلاوه مقایسه آمینو اسیدهای درگیر در جایگاه اتصال سوبسترا نشان داد که حفره اتصال فتوپروتئینهای کتنوفوری حاوی تعداد کمی از اسیدهای آمینه حلقوی ( آروماتیک) می باشد. این مشاهدات می تواند مارا به کاهش میانکنشهای stacking میان سوبسترا و پروتئین و بدنبال آن اهمیت اثرات پایداری کلنترازین در حفره هدایت نماید. پروفایل هیدروپاتی برای رزیدوهای حفره الگوی متفاوتی را در این دوگروه نشان داد. تفاوت اسیدهای آمینه در جایگاه اتصال سوبسترا و محیط اطرافش سبب الگوی متفاوت شبکه پیوند هیدروژنی در ناحیه مربوطه در کتنوفورها در مقایسه با کلنتراتها می شود . مقایسه ساختاری این دو گروه با تشابه توالی پایین و تشابه ساختمان سوم بالا می تواند یک دیدگاه جدیدی را در مکانیسم تابش نور در این فتو پروتئینها ایجاد می نماید.
منابع مشابه
Invading Mnemiopsis leidyi as a potential threat to Baltic fish
The occurrence of the ctenophore Mnemiopsis leidyi as a new invasive species in the Baltic Sea and the potential consequences for fish stock recruitment was investigated in spring 2007. The study focused on the Bornholm Basin, which serves as the major spawning ground for cod and sprat, the commercially most important fish stocks in the Baltic. The distribution pattern of M. leidyi revealed a s...
متن کاملRegulation and regeneration in the ctenophore Mnemiopsis leidyi.
Lobate ctenophores (tentaculates) generally exhibit a remarkable ability to regenerate missing structures as adults. On the other hand, their embryos exhibit a highly mosaic behavior when cut into halves or when specific cells are ablated. These deficient embryos do not exhibit embryonic regulation, and generate incomplete adult body plans. Under certain conditions, however, these deficient ani...
متن کاملSpecific immune priming in the invasive ctenophore Mnemiopsis leidyi.
Specific immune priming enables an induced immune response upon repeated pathogen encounter. As a functional analogue to vertebrate immune memory, such adaptive plasticity has been described, for instance, in insects and crustaceans. However, towards the base of the metazoan tree our knowledge about the existence of specific immune priming becomes scattered. Here, we exposed the invasive ctenop...
متن کاملبررسی نقش ef-hand i در ساختار و عملکرد فتوپروتئین mnemiopsin ازکتنوفورmnemiopsis leidyi با استفاده از جهش زایی هدفدار
به فرآیند تبدیل انرژی شیمیایی به انرژی مرئی نورانی توسط موجودات زنده بیولومنیسانس گویند و امروزه با توجه به بالا بودن درصد سیگنال فوتون به نویز پس زمینه، بیولومینسانس کاربرد های زیادی در حوزه های مختلف علوم زیستی پیدا نموده است. تا کنون هشت نوع فتوپروتئین وابسته به کلسیم گزارش شده که از این میان تنها فتوپروتئین نمیوپسین از شانه دار mnemiopsis leidyi تعیین توالی و بصورت نوترکیب بیان نشده است. در...
Evidence of Diel Vertical Migration in Mnemiopsis leidyi
The vertical distribution and migration of plankton organisms may have a large impact on their horizontal dispersal and distribution, and consequently on trophic interactions. In this study we used video-net profiling to describe the fine scale vertical distribution of Mnemiopsis leidyi in the Kattegat and Baltic Proper. Potential diel vertical migration was also investigated by frequent filmin...
متن کاملMnemiopsis leidyi Invasion and Biodiversity Changes in the Caspian Sea
1.1 Caspian Sea The complex history of the Caspian Sea formation has lead to a variety of different habitats. Like Australia, the Caspian Sea became isolated thousands of years ago (Plate 1). This isolation led to the speciation of many rare animals in particular the sturgeon. The Caspian Sea is the biggest enclosed body of water on Earth, having an even larger area than that of the American Gr...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم انسانی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023